禽流感的潜伏期从几小时到3天不等，潜伏期的长短依赖于感染病毒的毒力和剂量、感染途径、被感染禽的种别和禽体的状态。禽流感的症状极为复杂，家禽感染流感病毒后，有不显性感染、亚临床感染、轻度呼吸道疾病、产蛋量下降。通常呈体温升高，精神沉郁，饮食减少，消瘦，母禽产蛋量下降。有时也可能出现呼吸道症状，咳嗽、喷嚏、罗音、呼吸困难，病禽流泪，羽毛松乱，身体蜷缩。有的病禽出现神经症状和下痢。高致病性禽流感病毒（HPAIV）感染后，可出现头和面部水肿，鸡冠和肉垂肿大并发绀，脚鳞出血等症状。禽流感的发病率和死亡率差异很大，取决于禽类种别和毒株以及年龄、环境和并发感染等，通常情况为高发病率和低死亡率。在高致病力病毒感染时，发病率和死亡率可达１００％。