鸽舍消毒目的在于消除各种病原体，控制疾病的发生，在消毒前除清扫鸽舍、鸽舍了入门口和各种用具上的排泄物外，对剩留的鸽舍缝隙之间和角落里的料、粪也清除干净，然后用热水或清洁剂洗擦干净，最后消毒药水冲洗。一般情况可用01%新洁尔溶液、如若怀疑有病毒感染，则可用1——3%热碱水消毒后，间隔1—2小时再用清水冲洗净碱液（防止碱烧伤鸽爪），亦可用10—20%石灰刷墙和撒在场地上。